Il 25 ottobre 1956 i 43 soci fondatori (guidati dal Presidente Giovanni Casalini), alla presenza del notaio Fausto Monticelli, firmano l'atto costitutivo della Cassa Rurale di San Marzano di San Giuseppe allo scopo di: «procurare il credito in primo luogo ai propri soci e compiere le operazioni ed i servizi di banca consentiti dalla legge e dallo Statuto prevalentemente a favore di agricoltori, il miglioramento delle condizioni morali ed economiche dei quali costituisce la principale ragion d'essere; [inoltre si intende] fare opera di propaganda per il risparmio e la previdenza».
Missione, interpretata alla perfezione tanto da Consiglio d'Amministrazione del Presidente e Fondatore Casalini, quanto dal ristretto gruppo operativo coordinato dal Direttore Generale Antimo Schiavilla.

Nel 1988, con la scomparsa dell'Avvocato Giovanni Casalini, Presidente viene eletto all'unanimità Francesco Cavallo, giovane e lungimirante imprenditore e punto di riferimento per l'economia locale. La Banca rimane monosportello fino al 1991, anno in cui viene inaugurata la filiale di Francavilla Fontana.

Nel 1995, alla guida arriva il Direttore Generale Emanuele di Palma, che, forte di importanti esperienze acquisite in grandi gruppi bancari e su principali piazze italiane, dà una chiara impronta di management dinamico. La Banca riesce a superare la tradizionale politica conservativa ed inizia una fase di forte sviluppo, senza mai perdere l'attenzione ai bisogni specifici del territorio di riferimento.

Nei successivi anni vengono inaugurate le filiali di Grottaglie (1996), Taranto (2000), Faggiano (2001), Villa Castelli (2003).

Nella prima metà degli Anni Duemila, la Banca ha rafforzato la propria solidità e presenza sul territorio. A febbraio 2006 ha inaugurato la filiale di Leporano e a cavallo con l'anno successivo quello che era un presidio di tesoreria (nella Cittadella delle Imprese) è diventata la seconda filiale di Taranto.

In concomitanza con i primi vagiti della grande crisi economico-finanziaria della seconda parte del primo decennio del nuovo secolo, la BCC San Marzano di San Giuseppe dà un'ulteriore prova di sostanza e robustezza, vedendosi assegnare il rating positivo dalla società Standard & Poor's. E' la più piccola banca al mondo ad essere sottoposta al rating e l'unica da Teramo in giù in Italia.

La crescita dell'Istituto è ulteriormente rafforzata dal piano di sviluppo. Così, nel 2008, la BCC San Marzano di San Giuseppe guarda oltre Taranto aprendo la prima filiale a nord del Capoluogo, Massafra. Seguono, a ruota, la nuova filiale di Grottaglie (2009) con annesso Auditorium (un vero gioiello del design); la nuova filiale di Faggiano che nasce come polo formativo con aule didattiche (2009), l'inaugurazione dell'agenzia di Sava e della filiale Taranto 2 che, per essere più vicina al tessuto economico e sociale del capoluogo, si trasferisce dalla Cittadella delle Imprese al Rione Italia-Montegranaro.

Una crescita corroborata da molteplici e prestigiosi riconoscimenti fra i quali: a novembre 2008 è la prima BCC italiana a vedersi assegnato l'Oscar di Bilancio, successo rafforzato, a maggio successivo, dall'assegnazione del Sodalitas Social Award per l'impegno sociale.

In tal modo la BCC di San Marzano di San Giuseppe è riuscita ad operare il necessario salto di qualità che le ha consentito di offrire agli oltre 1500 soci e ai 18000 clienti i migliori servizi e i prodotti bancari disponibili sul mercato, diventando la Banca di punta del sistema cooperativo delle province di Taranto e Brindisi.